江西省水文局是省水利厅领导的参照公务员法管理事业单位。省水文局机关设17 个职能管理机构，下属赣州、吉安、宜春、抚州、上饶、南昌、九江、景德镇、鄱阳湖等9个水文局。行使全省水文站网规划与建设、水文监测与预报、水资源调查评价、水文监测资料汇交保管与使用、水文设施与水文监测环境保护等活动管理职能。

江西省水文局现已建成水文综合信息查询服务系统、水情分中心系统、山洪灾害暴雨洪水监测系统、地下水监测系统、墒情监测系统、鄱阳湖“百大哨口”监测系统。截至2010年，有水文站107处、基本水位站58处、基本雨量站719处、水质监测断面269处、地下水监测站18处、土壤墒情监测站30处、水生态试点监测站4处；山洪灾害预警监测站1480处、山洪水位监测站116处，拥有9个先进的水环境监测实验室，基本形成合理的站网布局和水文服务体系。

建制以来，江西省水文局以服务防汛抗旱减灾为重点，为水资源管理和水生态环境保护，为全省水利及经济社会发展提供了可靠的技术支撑。进入新世纪后，在支援四川抗震救灾、防御山洪灾害、应对突发水污染事件、支撑鄱阳湖经济区建设等重大任务中发挥了不可或缺的作用。20世纪90年代以来，江西水文减灾效益累计200亿元，被国家防办、水利部水文局历次表彰为“全国水情工作先进单位”，两次获得“全国水文先进集体”称号，两次被国家防总、人事部和解放军总政治部授予“全国防汛抗旱先进集体”荣誉，多次被省委省政府、省防总授予“全省防汛抗洪先进集体”，是江西省直文明单位。